1. Past perfect часто используется в косвенной речи не только после глагола said, но и told, asked, shouted, explained1, wondered2, wanted (to know) и т. д.
Я объяснил Алисе, что никогда не был в Индии.
Она спросила, читал ли Джон книгу.
Интересно, кто оставил дверь открытой?
2. При переводе прямой речи в косвенную данные глаголы часто заменяют глагол said. Ср.:
Джеймс сказал: "Я не понял тебя".
Джеймс объяснил, что не понял меня.
Полли сказала Тому: "Я иду в буфет".
Polly сказал Том, она собиралась в буфете.
Грег сказал: "Ты купил билеты на спектакль?"
Грег хотел знать, купил ли я билеты на спектакль.